Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP153P49790 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP153P49790 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP153P49790 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP153P49790 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NUP153P49790 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NUP153P49790 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms