Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35P42766 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms