Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA7P36544 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms