Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPB2P35606 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPB2P35606 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms