Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC079385.2-201ENST00000547531 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC073167.1-201ENST00000559303 580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 LINC00520-206ENST00000560336 883 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC007342.1-201ENST00000565073 706 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 LINC01934-205ENST00000435411 1771 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD11P31277 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC018638.6-201ENST00000605007 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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