Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA10P31260 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms