Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms