Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD1P28340 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD1P28340 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD1P28340 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms