Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSFA2P28290 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms