Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFKBIAP25963 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms