Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMA4P25789 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms