Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA6P23229 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA6P23229 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms