Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA1P20827 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA1P20827 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms