Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPCAMP16422 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms