Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODC1P11926 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODC1P11926 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODC1P11926 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms