Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHGAP10645 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHGAP10645 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHGAP10645 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGAP10645 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHGAP10645 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms