Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C8orf88P0DMB2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms