Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms