Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VIL1P09327 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIL1P09327 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIL1P09327 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIL1P09327 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VIL1P09327 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms