Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB2P05107 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGB2P05107 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms