Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSF2P04141 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSF2P04141 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSF2P04141 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSF2P04141 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSF2P04141 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSF2P04141 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSF2P04141 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CSF2P04141 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CSF2P04141 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSF2P04141 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSF2P04141 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSF2P04141 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms