Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM2O94769 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM2O94769 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM2O94769 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms