Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF6O75683 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF6O75683 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF6O75683 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF6O75683 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF6O75683 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF6O75683 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms