Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms