Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms