Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DENRO43583 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DENRO43583 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DENRO43583 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DENRO43583 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DENRO43583 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms