Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSH5O43196 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSH5O43196 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSH5O43196 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSH5O43196 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms