Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms