Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF6O14896 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRF6O14896 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRF6O14896 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF6O14896 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms