Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT5HO00267 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms