Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIEO00221 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms