Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2K7ER74 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms