Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms