Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC69A6NI79 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC69A6NI79 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms