Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLTPD2A6NH11 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLTPD2A6NH11 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLTPD2A6NH11 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms