Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF804BA4D1E1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms