Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSC5DA1L4H1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC5DA1L4H1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms