Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRADDQ15628 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TRADDQ15628 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
TRADDQ15628 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.59□□□□□ -2
TRADDQ15628 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRADDQ15628 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms