Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDE3BQ13370 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms