Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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