Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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ANKRD42Q8N9B4 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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ANKRD42Q8N9B4 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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ANKRD42Q8N9B4 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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ANKRD42Q8N9B4 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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ANKRD42Q8N9B4 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD42Q8N9B4 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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