Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SGCBQ16585 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SGCBQ16585 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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