Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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GRIK3Q13003 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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GRIK3Q13003 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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GRIK3Q13003 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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GRIK3Q13003 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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GRIK3Q13003 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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GRIK3Q13003 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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GRIK3Q13003 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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GRIK3Q13003 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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