Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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CSNK2A3Q8NEV1 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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CSNK2A3Q8NEV1 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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