Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHIC1Q5VXU3 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHIC1Q5VXU3 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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