Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN4PQ13434 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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MKRN4PQ13434 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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MKRN4PQ13434 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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MKRN4PQ13434 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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MKRN4PQ13434 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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MKRN4PQ13434 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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MKRN4PQ13434 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MKRN4PQ13434 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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