Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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GRIK3Q13003 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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GRIK3Q13003 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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GRIK3Q13003 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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