Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-8Q9BYQ9 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms