Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms