Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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