Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
FOXD1Q16676 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms